Cơ cấu tổ chức:
a, Các tổ chức, phòng chuyên môn, nghiệp vụ thuộc Sở:
- Văn phòng.
- Thanh tra .
- Phòng Kế hoạch-Tài chính.
- Phòng Quản lý kết cấu hạ tầng và An toàn giao thông.
- Phòng Quản lý vận tải phương tiện và người lái.
- Phòng Quản lý chất lượng công trình giao thông.
b, Các đơn vị sự nghiệp thuộc sở:
- Ban Quản lý Bến xe khách Hà Tĩnh.
- Trung tâm Tư vấn kỹ thuật giao thông Hà Tĩnh.